Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Nicn1Q9CQM0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Nicn1Q9CQM0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Nicn1Q9CQM0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Nicn1Q9CQM0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Nicn1Q9CQM0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Nicn1Q9CQM0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Nicn1Q9CQM0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Nicn1Q9CQM0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Nicn1Q9CQM0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Nicn1Q9CQM0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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