Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ccer1Q9CQL2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccer1Q9CQL2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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