Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufb5Q9CQH3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms