Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RTRAFQ9CQE8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTRAFQ9CQE8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTRAFQ9CQE8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTRAFQ9CQE8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTRAFQ9CQE8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTRAFQ9CQE8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTRAFQ9CQE8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTRAFQ9CQE8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTRAFQ9CQE8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTRAFQ9CQE8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTRAFQ9CQE8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTRAFQ9CQE8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTRAFQ9CQE8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTRAFQ9CQE8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTRAFQ9CQE8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTRAFQ9CQE8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTRAFQ9CQE8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RTRAFQ9CQE8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTRAFQ9CQE8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms