Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Use1Q9CQ56 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Use1Q9CQ56 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Use1Q9CQ56 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Use1Q9CQ56 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Use1Q9CQ56 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Use1Q9CQ56 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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