Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms