Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms