Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms