Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms