Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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