Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gins4Q99LZ3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gins4Q99LZ3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gins4Q99LZ3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gins4Q99LZ3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gins4Q99LZ3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms