Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms