Protein–RNA interactions for Protein: Q99LL3

Chst12, Carbohydrate sulfotransferase 12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst12Q99LL3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst12Q99LL3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst12Q99LL3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms