Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms