Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms