Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ddb2Q99J79 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ddb2Q99J79 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ddb2Q99J79 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ddb2Q99J79 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ddb2Q99J79 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ddb2Q99J79 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ddb2Q99J79 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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