Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rnf112Q96DY5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rnf112Q96DY5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rnf112Q96DY5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnf112Q96DY5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnf112Q96DY5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnf112Q96DY5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnf112Q96DY5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnf112Q96DY5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnf112Q96DY5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rnf112Q96DY5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rnf112Q96DY5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rnf112Q96DY5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rnf112Q96DY5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rnf112Q96DY5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms