Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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