Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms