Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms