Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ttc1Q91Z38 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ttc1Q91Z38 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ttc1Q91Z38 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ttc1Q91Z38 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ttc1Q91Z38 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ttc1Q91Z38 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ttc1Q91Z38 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ttc1Q91Z38 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ttc1Q91Z38 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ttc1Q91Z38 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc1Q91Z38 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc1Q91Z38 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc1Q91Z38 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc1Q91Z38 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc1Q91Z38 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc1Q91Z38 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc1Q91Z38 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc1Q91Z38 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ttc1Q91Z38 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms