Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms