Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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