Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms