Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms