Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fyco1Q8VDC1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms