Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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