Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms