Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Defb12Q8K4N3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms