Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r188Q8K3N2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms