Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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