Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms