Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Trim68Q8K243 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Trim68Q8K243 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Trim68Q8K243 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Trim68Q8K243 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Trim68Q8K243 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Trim68Q8K243 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Trim68Q8K243 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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