Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Nek9Q8K1R7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Nek9Q8K1R7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Nek9Q8K1R7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Nek9Q8K1R7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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