Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkn3Q8K045 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkn3Q8K045 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkn3Q8K045 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkn3Q8K045 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkn3Q8K045 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkn3Q8K045 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkn3Q8K045 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkn3Q8K045 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkn3Q8K045 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkn3Q8K045 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkn3Q8K045 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkn3Q8K045 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkn3Q8K045 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkn3Q8K045 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkn3Q8K045 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms