Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZP2

Syn3, Synapsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syn3Q8JZP2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syn3Q8JZP2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms