Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI15

Sphk1, Sphingosine kinase 1, mousemouse

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk1Q8CI15 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Sphk1Q8CI15 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Sphk1Q8CI15 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sphk1Q8CI15 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sphk1Q8CI15 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sphk1Q8CI15 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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