Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Hpf1Q8CFE2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Hpf1Q8CFE2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Hpf1Q8CFE2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Hpf1Q8CFE2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Hpf1Q8CFE2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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