Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF25

UPF0575 protein C19orf67 homolog, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CF25 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8CF25 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8CF25 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8CF25 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8CF25 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8CF25 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8CF25 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8CF25 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8CF25 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8CF25 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8CF25 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8CF25 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8CF25 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8CF25 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8CF25 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8CF25 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8CF25 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8CF25 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8CF25 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8CF25 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8CF25 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8CF25 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8CF25 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8CF25 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8CF25 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8CF25 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8CF25 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8CF25 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8CF25 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8CF25 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8CF25 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8CF25 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8CF25 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8CF25 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8CF25 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Q8CF25 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8CF25 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8CF25 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8CF25 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Q8CF25 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Q8CF25 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8CF25 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8CF25 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Q8CF25 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Q8CF25 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Q8CF25 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Q8CF25 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Q8CF25 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8CF25 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8CF25 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8CF25 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Q8CF25 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8CF25 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Q8CF25 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8CF25 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8CF25 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8CF25 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8CF25 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Q8CF25 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Q8CF25 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8CF25 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8CF25 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8CF25 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8CF25 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8CF25 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms