Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp27Q8CEG8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp27Q8CEG8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp27Q8CEG8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp27Q8CEG8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Usp27Q8CEG8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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