Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc9Q8CDN9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Lrrc9Q8CDN9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms