Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms