Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms