Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7R2

Gm3411, Predicted gene 3411, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3411Q8C7R2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3411Q8C7R2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3411Q8C7R2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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