Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Defa22Q8C1N8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Defa22Q8C1N8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Defa22Q8C1N8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa22Q8C1N8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa22Q8C1N8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa22Q8C1N8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa22Q8C1N8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa22Q8C1N8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa22Q8C1N8 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa22Q8C1N8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa22Q8C1N8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa22Q8C1N8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa22Q8C1N8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa22Q8C1N8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa22Q8C1N8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa22Q8C1N8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa22Q8C1N8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa22Q8C1N8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa22Q8C1N8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa22Q8C1N8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa22Q8C1N8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa22Q8C1N8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa22Q8C1N8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.2 ms