Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Atg16l1Q8C0J2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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