Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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