Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tnfsfm13Q8BXS2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tnfsfm13Q8BXS2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tnfsfm13Q8BXS2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tnfsfm13Q8BXS2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tnfsfm13Q8BXS2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tnfsfm13Q8BXS2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tnfsfm13Q8BXS2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tnfsfm13Q8BXS2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Tnfsfm13Q8BXS2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsfm13Q8BXS2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Tnfsfm13Q8BXS2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsfm13Q8BXS2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsfm13Q8BXS2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsfm13Q8BXS2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsfm13Q8BXS2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsfm13Q8BXS2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsfm13Q8BXS2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsfm13Q8BXS2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsfm13Q8BXS2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsfm13Q8BXS2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Tnfsfm13Q8BXS2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsfm13Q8BXS2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Tnfsfm13Q8BXS2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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