Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Iffo1Q8BXL9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms