Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms